時は、天政十四年…
世はまさに戦国時代、各地で領地をかけて戦が繰り広げられていた。
そんな時代の中、豊倉家は徳条家の奇襲攻撃によって落城…。
代々豊倉家に仕えていた『火衆の忍』によって、生き残ったのはまだ幼き赤子一人。
その赤子は、忍者里で修業をし大きく成長していくー
――そして、時は天政三十四年――
抜け忍となり、一人でひっそりと隠れ家に住む主人公(プレイヤー)。
ある日、森で倒れているつむぎと出会い、物語が動き出す―。